利福噴丁和利福平的主要區別在藥效、副作用等方面，在服用相同劑量的情況下，利福噴丁的抗結核能力比利福平的強，大概是利福平的2～10倍，而利福平的副作用比利福噴丁的大，利福平的副作用為惡心嘔吐、入睡困難、食欲不振和皮炎皮疹等，而利福噴丁通常會引起輕微的胃腸道反應 。

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