腱鞘囊腫不治療時間長了，可能會導致患處疼痛麻木加重影響關節活動，從而影響正常生活，但因其是良性，正常情況下不會惡變，如果腱鞘囊腫進行性增大疼痛劇烈，影響關節活動甚至有局部神經壓迫癥狀，如患肢麻木、無力等，可酌情進行囊腫壓迫，使其破裂治療或者穿刺抽液甚至手術治療。

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