毛囊炎和硬下疳的區別在于，硬下疳是一期梅毒的皮膚表現，是由梅毒螺旋體感染性接觸部位導致，而毛囊炎是細菌感染引起的，大多數是金黃色葡萄球菌，該種細菌侵入毛囊所導致的亞急性或者慢性化膿性的疾病 。

兩者在臨床表現上也有明顯不同，硬下疳的主要特征是紅斑、丘疹、硬結等，而毛囊炎的主要特征是以毛囊為中心的紅色丘疹，常伴有瘙癢、疼痛等癥狀 。

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