泌尿道感染的藥物治療，要根據致病微生物的種類決定，在治療選擇藥物之前進行尿培養檢查，明確致病微生物的種類和藥物敏感性，再選擇藥物，常用的包括磺胺類、呋喃類、喹諾酮類抗菌藥、頭孢菌素消炎藥、大環內酯類、青霉素類、非甾體類消炎藥、氨基糖苷類抗生素等 。

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