京東自營和旗艦店是京東商城的兩種主要店鋪類型，它們之間的主要區別在于商家類型、商品質量和售后服務。

1、商家類型：京東自營店是由京東直接運營的店鋪，商家只需向京東供應商品并遵守京東的規定，而旗艦店則是由品牌官方或者授權的第三方商家開設的，商家需要自行管理店鋪、提供商品并負責售后服務。

2、商品質量：京東自營店的商品質量通常由京東嚴格把關，確保正品率較高，而旗艦店則取決于品牌方和商家的信譽，商品質量可能參差不齊。

3、售后服務：京東自營店提供的售后服務由京東負責，消費者可以享受到一定的售后保障，而旗艦店的售后服務則取決于商家自身，消費者在購買時需要注意查看商家的售后服務政策。

4、價格優惠：由于京東自營店的商品成本相對較低，因此部分商品價格可能會比旗艦店更優惠，但也有部分品牌旗艦店會提供獨家優惠活動，以吸引消費者。

5、購物體驗：京東自營店的商品種類豐富，購物流程簡單快捷，而旗艦店則更注重品牌形象和購物體驗，部分旗艦店會提供線上試衣、預約配送等增值服務。

京東自營店和旗艦店各有優缺點，消費者在購買時可以根據自己的需求和喜好選擇合適的店鋪。

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