公租房和商品房的主要區別在于產權、租金和購買方式，公租房的產權歸政府或公共機構所有，租金較低，面向低收入群體；商品房的產權歸個人或企業所有，租金較高，購買需通過市場交易，公租房的供應主要受政府政策調控，數量有限；商品房則根據市場需求和土地供應自主開發，數量較多。

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