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有機肥和化肥的主要區別在于來源和成分，有機肥是通過動植物殘體、糞便等含有豐富營養的有機物質經過發酵、腐熟而成的，主要來源于自然界的有機物，而化肥是人工合成或通過化學反應制得的含有一定營養元素的化學物質，主要來源于礦物資源，在成分上，有機肥中含有多種微生物、蟲卵等生物活性物質，能改善土壤結構，提高土壤肥力；而化肥則主要以氮、磷、鉀等營養元素為主，能迅速補充土壤養分，但長期使用可能導致土壤板結、環境污染等問題。

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