百日咳和過敏性咳嗽在發病原因、臨床表現、檢查結果、治療方法、預后等方面均有不同，百日咳是由百日咳桿菌感染引起的急性呼吸道傳染性疾病，特征性的臨床癥狀為陣發性、痙攣性咳嗽，咳嗽終末出現深長的雞鳴樣吸氣性吼聲，病程長達2-3個月，所以稱之為“百日咳”，以小于5歲兒童為主，曾是全球嬰幼兒死亡的重要原因之一；其傳染性極強，目前已被列為我國乙類傳染病進行管理 。

而過敏性咳嗽在醫學上被稱為變異性咳嗽，多數是由于接觸到了過敏原，如花粉、灰塵等，引起呼吸道炎癥反應所致，其主要表現為反復發作的干咳或帶痰咳嗽，常伴有流涕、鼻塞等癥狀 。

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